香港科大自2003年开始在内地自主招生。按照国家教育部的指示，招生范围由最初的四省两巿扩大至现时全国三十一省巿。至今，香港科大在各省巿合共招收了1400名内地优秀学生。香港科大的毕业生，深受香港及跨国企业欢迎。2011年内地的毕业生，超过三成留港工作，而选择深造者逾六成，当中四分之三的同学赴北美西欧著名大学深造，包括：哈佛丶普林斯顿丶斯坦福丶耶鲁丶哥伦比亚丶牛津丶加州大学丶麻省理工等。

　　香港科大2012年全国招生名额约150名，各省巿不设特定名额。参加2012年国家统一高考的考生自2012年1月26日起，至6月11日止，可透过香港科大网上系统提交申请。高考成绩符合面试分数要求者，将获邀参加香港科大的面试评核，再择优录取。香港科大希望在各省巿招收最优秀的同学，不但要求考试成绩优异，思想活跃，还具备领导才干，并勇于接受各类不同的挑战。部份成绩特别优秀的同学将获颁发奖学金。